Revio de PacBio fournit 15 fois plus de données HiFi et de génomes humains

Medical Devices

PacBio (NASDAQ : PACB), l'un des principaux développeurs de solutions de séquençage de haute qualité et très précises, a annoncé le système de séquençage à lecture longue Revio™, qui permettra aux clients d'étendre considérablement leur utilisation de la célèbre technologie de séquençage HiFi de PacBio. Revio est conçu pour offrir aux clients la possibilité de séquencer jusqu'à 1 300 génomes entiers humains par an avec une couverture de 30 fois pour moins de 1 000 $ par génome. Avec cette échelle et ce prix, PacBio pense que Revio permettra l'utilisation du séquençage HiFi pour de grandes études en génétique humaine, en recherche sur le cancer, en génomique agricole, etc. « Nos clients ont transformé la génomique grâce à la puissance du séquençage HiFi. Revio libérera davantage cette puissance en ajoutant un débit élevé et un prix abordable », a déclaré Christian Henry, président et chef de la direction de PacBio. "Nous avons conçu une cellule SMRT entièrement nouvelle avec une densité trois fois plus élevée que notre cellule SMRT 8M existante, résultant en 25 millions de ZMW. Revio exécutera jusqu'à quatre cellules SMRT en parallèle, ce qui fournit jusqu'à 100 millions de ZMW pour le séquençage simultané de molécules uniques. Combiné à des avancées significatives dans notre calcul, Revio offrira des temps d'exécution plus courts et une multiplication par 15 des données HiFi. Je suis ravi de voir ce que les chercheurs peuvent découvrir en utilisant la puissance de Revio. Les scientifiques ont réalisé de nombreuses « premières » avec le séquençage HiFi sur le système de séquençage PacBio Sequel IIe – le premier assemblage complet de télomère à télomère d'un génome humain (Nurk 2022), le premier méthylomes résolus par haplotype dans une cohorte de maladies rares (Cheung 2022), les premières enquêtes de population sur la variation structurelle avec de longues lectures (All of Us Research Program), les premiers catalogues d'isoformes complets unicellulaires (Al'Khafaji 2021) et le premier assemblage complet du génome très complexe de l'avoine (European Seed 2020). Revio utilise la même chimie HiFi révolutionnaire - produisant des lectures longues natives précises avec une couverture uniforme, des performances d'application extraordinaires pour l'appel et l'assemblage de variantes, et une détection précise de la méthylation de l'ADN - mais à une échelle beaucoup plus grande. Revio sera le premier système de PacBio à intégrer des GPU NVIDIA à la pointe de la technologie, offrant une puissance de calcul multipliée par 20 par rapport à Sequel IIe. En plus de fournir des appels de base accélérés pour répondre au débit plus élevé de Revio, le calcul activé par l'IA intégrera des algorithmes d'apprentissage en profondeur pour détecter la méthylation de l'ADN à partir de bibliothèques de séquençage standard, et DeepConsensus, une méthode d'apprentissage en profondeur développée avec Google Health pour améliorer le rendement et la précision de HiFi séquençage. Revio nécessitera 50 % de consommables en moins que Sequel IIe et comprend des améliorations substantielles en termes de flux de travail et de commodité. Revio permettra de configurer une exécution ultérieure pendant que l'exécution en cours est en cours, ce qui offre une flexibilité de planification accrue pour qu'un opérateur puisse charger des exécutions à tout moment de la journée et maximiser le débit du système. "Dans notre programme Genomic Answers For Kids (GA4K), le séquençage du génome HiFi montre une véritable avancée au-delà de l'analyse génétique contemporaine dans des échantillons de maladies rares non résolues", a déclaré Tomi Pastinen, MD, PhD, directeur du centre de médecine génomique de Children's Mercy Kansas City. « Un débit accru du système de séquençage Revio à moindre coût accélérerait les réponses dans GA4K. » « Le nouveau système de séquençage Revio de PacBio sera un élément clé de notre boîte à outils génomique chez Corteva. Le séquençage à lecture longue a permis la caractérisation de génomes végétaux complexes et désormais, les capacités à haut débit de Revio nous permettront d'appliquer la technologie HiFi à un plus large éventail d'applications en biotechnologie agricole », a déclaré Gina Zastrow-Hayes, Biotechnologie et GT-Génomique Responsable technologique chez Corteva Agriscience. Revio a un prix catalogue de 779 000 $ US. PacBio accepte maintenant les commandes et a l'intention de commencer la livraison au premier trimestre 2023.

“PacBio a annoncé le système de séquençage à lecture longue Revio™, qui permettra aux clients d'étendre considérablement leur utilisation de la célèbre technologie de séquençage HiFi de PacBio“
See all the latest jobs in Medical Devices
Retour aux nouvelles