Une approche de test révèle de nouveaux gènes de risque de démence
ScienceUne nouvelle étude dirigée par l'UCLA a utilisé une combinaison de nouvelles méthodes de test, permettant un dépistage de masse de variantes génétiques dans une seule expérience, et a identifié un certain nombre de nouveaux gènes à risque pour la maladie d'Alzheimer et un trouble cérébral connexe rare appelé paralysie supranucléaire progressive ( PSP). Un nouveau modèle révisé a en outre été présenté dans l'étude qui montre comment les variantes génétiques courantes peuvent collectivement augmenter le risque de maladie en perturbant des programmes de transcription spécifiques à travers le génome. Les chercheurs se sont généralement appuyés sur des études d'association à l'échelle du génome (GWAS), dans lesquelles ils étudient les génomes d'un grand groupe de personnes pour classer les variantes génétiques qui augmentent le risque de maladie. Cela se fait en testant des marqueurs le long du chromosome associés à une maladie. Cependant, il peut être difficile d'identifier quelles sont les variantes fonctionnelles qui causent la maladie car chaque chromosome, en moyenne, a en commun des dizaines de marqueurs génétiques qui sont co-hérités et donc associés à la maladie. Cette étude apporte une solution appropriée pour s'attaquer à ce problème dans la biomédecine moderne, en identifiant les variantes causales et les gènes qu'elles impactent. Les auteurs effectuent massivement des essais de rapporteurs parallèles pour tester simultanément environ cinq mille sept cents variantes génétiques dans vingt-cinq chromosomes associés à la maladie d'Alzheimer et neuf associés à la PSP, une maladie neurologique avec une pathologie similaire à la maladie d'Alzheimer. Les auteurs ont identifié trois cent vingt variantes génétiques fonctionnelles à partir de ce test. Ils ont également exécuté un écran CRISPR regroupé sur quarante-deux de ces variantes dans plusieurs types de cellules pour authentifier les résultats. Le Dr Dan Geschwind, l'auteur correspondant de l'étude, a déclaré : "Nous avons combiné plusieurs avancées qui permettent de mener une biologie à haut débit, dans laquelle au lieu de faire une expérience à la fois, on fait des milliers d'expériences en parallèle dans une sorte de pooling Cela nous permet d'aborder ce défi consistant à passer de milliers de variantes génétiques associées à une maladie à l'identification de celles qui sont fonctionnelles et des gènes qu'elles affectent.
“Une nouvelle étude dirigée par l'UCLA a utilisé une combinaison de nouvelles méthodes de test, permettant un dépistage de masse des variantes génétiques en une seule expérience.“
